Tipo: Libro impreso / Print book
Encuadernación / Binding: Tapa blanda / Paperback
Tamaño / Size: 17 x 24 cm
Páginas / Pages: 150
Resumen / Summary:
Autor / Author: Varios Autores
Editorial / Publisher: Universidad Distrital Francisco José de C
Entrega / Delivery : Nacional / International
Envio desde / Ships from: Colombia
Condición / Condition: Nuevo / New
Tabla de contenido / Table of contents: Introducción a Python
¿Qué es Python?
Características
Instalación de Python
Instalación en Windows
Instalación en GNU/ Linux
Primer programa con Python
Tipos de datos básicos
Estructuras de datos
Operadores
Estructuras de control de flujo
Funciones
Módulos y paquetes
Excepciones
Capítulo I
Introducción a Biopython
¿Qué es Biopython?
¿Para quién es Biopython?
Requerimientos
Instalación de Numpy
Instalación de Biopython
Capítulo II
Trabajar con secuencias básicas
Trabajando con diferentes tipos de alfabeto
Operaciones con el objeto Seq
Traducción
Complemento y complemento reverso
Secuencias mutables
Secuencias a Strings
Capítulo III
Trabajar con secuencias con más información
¿Cuándo utilizar SeqRecord?
Características y atributos de SeqRecord
Crear un objeto SeqRecord
Crear un objeto SeqRecord con características
Creación de características
Impresión en diferentes formatos
Cortar y operar objetos SeqRecord
Capítulo IV
Crear secuencias desde archivos y texto
¿Cuándo utilizar Bio.Sequio?
Leer desde archivos con solo una secuencia
Leer desde archivos con múltiples secuencias
Leer desde archivos comprimidos
Capítulo V
Escribir secuencias a archivos
Capítulo VI
Trabajar con alineamiento de secuencias
Biopython y ClustalW
Instalación de ClustalW
Generación de un filograma
Biopython y MUSCLE
Lectura desde archivos de múltiples alineamientos
Conversión entre formatos de alineamiento
Capítulo VII
Ejecutar BLAS y leer sus resultados
Ejecutar BLAST en Internet
Ejecutar BLAST en Local
Ejecución
Leer desde la salida de BLAST
Capítulo VIII
Conexión con bases de datos biológicas
Entrez
Entrez y Biopython
Buscar registros relacionados
Capítulo IX
Creación de árboles filogenéticos
Biopython y Filogenia
Generar árboles en ASCII
Generar árboles en imágenes
Editar filograma
Algunas funciones útiles de los árboles
Capítulo X
Códigos de ejemplo
Código de ejemplo 1. Hallar el contenido de GC
Código de ejemplo 2. Convertir entre diferentes formatos
Código de ejemplo 3. “Voy a tener suerte” versión
Entrez con proteínas
Código de ejemplo 4. Leer desde una salida de BLAST y guardar en una base de datos MySQL
Código de ejemplo 5. Crear un árbol filogenético a partir de varios archivos de secuencias Fasta
FAQ
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